Несмотря на известность и уважение в кругах единомышленников, массу друзей и почитателей, умирала Кристин Джоргенсен в одиночестве от рака легких и мочевого пузыря. Случилось это накануне ее 63-летия. Ее часто спрашивали, не жалеет ли она о том, что не создала семью, не стала матерью, на что она отвечала, что, даже не обретя женского счастья, она нашла себя.